需要先向人社局申请认定工伤，如果人社局不予认定，则提起行政诉讼。这是程序。但就您描述的问题，个人认为不属于职业病，也比较难以证明二者因果关系，确实难以认定工伤，建议和单位协商处理，妥善解决为好。

您这种情况最好以公司的形式经营，确定您的股权，将来万一您无法继续经营，您的股权还是有的，他们是没有办法占有的。